咖啡的种类繁多，主要分为三大类：阿拉比卡、罗布斯塔和利比里亚，但在市场上流通的主要是前两种。每一种都有其独特之处，不同用途也需要不同的咖啡品种。

其中，阿拉比卡、罗布斯塔和利比里亚被称为“咖啡三大原生种”。它们分别属于Coffea arabica、Coffea robusta Linden和Coffea liberica这三个学名。

阿拉比卡是最受欢迎的品种，它们最初在埃塞俄比亚高原上被发现，并且通过贸易传到了欧洲。在所有咖啡中，阿拉比卡占据了75%到80%的份额。它因其优美的风味和香气而受到青睐。但它对干燥、霜冻以及病虫害等天敌较弱，对叶锈病尤其敏感。

除了南美洲（除巴西与阿根廷部分地区外）、中美洲非洲以及亚洲一些区域以外，其他地方也生产着高质量的阿拉比卡豆。

罗布斯塔则更耐热，更能抵御叶锈病，这使得它适合于那些不适合生长高温多湿环境的地方。虽然仅占混合咖啡中的2%至3%，但由于其独特风味，它在速溶咖啡和液体冲泡等工业应用中扮演着重要角色。而且，由于含有较多咖啡因，其含量约为1.5%，远高于其他品种。

印度尼西亚越南及科特迪瓦、安哥拉等国是罗布斯塔的大宗产地，而越南近年来正致力于成为主要生产国之一。

最后，利比里亚是一种耐热又能适应各种环境条件，但对叶锈病仍然敏感，因此只在少数国家内部交易或用于研究。此外，由国际coffee组织统计显示，在全球市场上，大约65%的是由Arabica制成，而剩下的35%则由Robusta制成。这两者的形态差异很明显，即一颗细长扁平，一颗浑圆充满活力。