咖啡的三大原始种类是阿拉比卡、罗布斯塔和利比里亚，尽管市场上流通的主要是前两者。每一种咖啡都有其独特之处，不同用途和目的决定了它们各自的价值。咖啡植物中，有40多种能够产生商业化的豆子，但仅限于这三大原始种。

阿拉比卡（学名Coffea arabica）起源于埃塞俄比亚高原，最初被用于药用，最终发展成为烘焙饮用的习惯。它占全球咖啡消费量的大部分，并且因其卓越的风味和香气而广受欢迎。但它对干燥、霜冻和病虫害等环境条件非常敏感。

罗布斯塔（学名Coffea robusta Linden）是一种耐叶锈病的品种，适宜生长在高温多湿地区，如非洲刚果发现的地方。罗布斯塔具有独特而鲜明的香味与苦味，它们通常用于工业生产，如速溶咖啡或液体咖啡。在含量上，它含有3.2%以上的咖啡因，而阿拉比卡只有1.5%左右。

利比里亚（学名Coffea liberica），则以西非为其原产地，对各种环境都有很强适应能力，但不耐叶锈病。这使得利比里亚在西非国家内部交易或者作为研究对象栽培罕见。

根据国际coffee组织(ICO) 的统计，在全球市场上，大约65%的是阿拉比卡种，35%是罗布斯塔种。从形状来看，阿拉比卡豆粒细长扁平，而罗布斯塔更为浑圆，这也是区分它们的手段之一。此外，由于这些植物对于不同的环境条件有着不同的反应，因此选择哪一种也取决于所需的地理位置和天气状况。