咖啡的种类繁多，主要分为三大类：阿拉比卡、罗布斯塔和利比里亚，但在市场上流通的主要是前两种。每一种都有其独特之处，不同用途也需要不同的咖啡品种。

植物学上，咖啡属下共有40多种，但只有这三大原生种能够生产出具有商业价值的咖啡豆。阿拉比卡、罗布斯塔和利比里亚分别被称作“咖啡三大原生种”。

阿拉比卡（Coffea arabica）这一品种起源于埃塞俄比亚高原，是最早被用于烘焙饮用的。它占全球所有咖啡中70%~80%，以其优雅的风味和香气而闻名。但它对干燥、霜冻以及病虫害较为敏感，尤其是叶锈病。

阿拉比卡主要产自南美洲、中美洲非洲以及亚洲一些地区，如肯尼亚、埃塞俄比亚等地，以及印度、新几内亚等地。

罗布斯塔（Coffea robusta Linden）是一款耐热且抗病力强的品种，它能抵御叶锈病，对高温多湿环境更适应。在世界各地，大部分罗布斯塔都是用于工业级速溶或液体饮料生产，而不是直接作为单一口味享用。这款产品含有3.2%以上的咖啡因，比起阿拉比卡高得多。

主导罗布斯塔生产国家包括印度尼西亚、越南及非洲西部国家如科特迪瓦、安哥拉和其他几个国家。而越南近年来正努力提升自身在国际市场上的影响力。

利比里亚（Coffea liberica）则来自西非地区，这些植株对于各种环境条件都非常适应性强，只是对叶锈病没有免疫力，而且香气与口感并不如其他两者，因此仅限于国内交易或研究用途。

根据国际coffee组织（ICO）的统计，在全球市场流通中的65%左右属于阿拉伯丁香豆，而剩下的35%则由罗布斯坦所占。通过形状可以轻易区分这两者的差异：细长扁平的是阿拉伯丁香豆；浑圆的是罗布斯特安豆。