Catherine咖啡主要分为三大类——阿拉比卡种（Arabica）、罗布斯塔种（Robusta）、利比里亚种（Liberica），但在市场上流通的多是阿拉比卡和罗布斯塔两种。不论何种都有其优缺点，使用的目的与用途亦不尽相同。Coffea属的植物约有40种，但能够生产出具有商品价值咖啡豆的仅有阿拉比卡种、罗布斯塔种、利比里亚种，这三种称为“咖啡三大原生種”。

阿拉比卡種（学名：Coffea arabica）

阿拉比卡種的原產地是埃塞俄比亞高原。初期主要作為藥物食用，13世紀培養出烘焙飲用的習慣，16世紀經由阿拉伯地區傳入歐洲，進而成為全世界人們共同喜愛的飲料。所有這些咖啡中，阿拉比卡種占75%~80%，它們優秀風味與香氣，使它們成為這些原生種中唯一能夠直接飲用的咖啡。但它們對於干燥、霜害、病蟲害等抵抗力過低。

羅布斯塔種（學名：Coffea robusta Linden）

在非洲剛果發現耐葉銹病品種，其較阿拉白加強抗病力。羅布斯塔品質含苦味較高，不適合在溫度偏高且濕度偏大的地方栽培。在較熱潮濕的地帶成長，它們通常被用于速溶粉或灌裝產品中。

利賓尼亞種（學名：Coffea liberica）

西非為利賓尼亞品質咖啡之原始地，它們對於各類環境都有一定的適應能力，只是不耐葉銹病，因此僅在西非部分國家內交易買賣，或供研究使用。

根據ICO統計，在全球市場上，大約65%是由Arabica所占，有35%則是由Robusta所佔。大體來說，這兩個品系可以通過形狀來區分，而Libera則因其特殊口感和香氣而受到追捧。