影响月经周期

咖啡中的咖啡因会刺激荷尔蒙系统，可能导致体内雌激素水平下降，从而影响女性的月经周期。长期饮用高咖啡因饮料可能引起 amenorrhea（失去月经）或者 oligomenorrhea（间隔较长的月经）。此外，咖啡也可能加剧已经存在的性激素相关疾病，如多囊卵巢综合征。

增加骨质流失

虽然短暂且适量摄入咖啡并不会对骨骼产生显著影响，但研究表明，高剂量或长期摄入过多咖啡因会增加女性骨密度降低和脆弱性的风险。这是因为高浓度的 咔嗒因可抑制身体对于维生素D和钙等矿物质吸收，从而减少新形成骨组织的质量。

引起睡眠障碍

大量消费含有高度提取率或较高浓度的一杯中强烈、热腾腾、带有苦味口感的深色种类如意大利罗布斯塔或阿拉比卡等，可以阻碍人体产生赖氨酸，这是一种与促进快速眼动睡眠(Rapid Eye Movement, REM)相联系的大胺酸，是人们进入梦境阶段所必需的一种氨基酸。因此，在晚上过分摄入这些类型的人往往难以进入深层睡眠状态，并在早晨感到疲倦。

加剧心血管疾病风险

虽然适量饮用不含糖添加剂和乳脂肪成分的人造奶油调制品后的黑巧克力每天可以提供一定数量的心血管保护抗氧化剂，但如果你患有某些心脏问题，比如肥厚型心肌症，那么额外增加任何形式的心血管压力都不是一个好主意。特别是那些本来就应避免辛辣食物和其他刺激性食物的人们，更应该谨慎处理这一点，因为他们更容易受到额外刺激性的负面效应。

影响皮肤状况

许多女性注意到，他们喝了很多咖啡后，不仅感觉更加兴奋，还发现自己的皮肤变得干燥紧绷。在这种情况下，水分排斥可能是由于身体为了补偿从尿液中丢失出来更多水份而做出的反应。而当再次试图通过服用补充品来解决这个问题时，它们实际上还能进一步削弱皮肤屏障功能，使得干燥的情况恶化。此外，由于其直接导致夜间排汗增多，对一些敏感肌肤来说也许会引发轻微红晒甚至痘痘出没的问题。