咖啡的三大原生种——阿拉比卡、罗布斯塔和利比里亚，虽然市场上主要流通的是前两种，但每一种都有其独特之处和用途。这些品种共计40多种，只有这三者能生产出商业价值的咖啡豆。其中，阿拉比卡是最受欢迎的品种，它占咖啡总产量的75%到80%，以其优美的风味和香气闻名。但它对干燥、霜冻和病虫害不耐受，尤其是叶锈病。

阿拉比卡主要产于南美洲（除巴西与阿根廷部分地区外）、中美洲、非洲（如肯尼亚、埃塞俄比亚等地）以及亚洲的一些国家，如也门、印度以及巴布亚新几内亚的一部分区域。

罗布斯塔则是在刚果发现的一个耐性较强品种，对叶锈病有更好的抵抗力。它适应高温多湿环境，因此在一些热带地区成为首选。在混合饮料中仅占2%至3%，但由于其独特而鲜明的苦味，其影响力并不小。这类咖啡因含量约为1.5倍于阿拉比卡，是速溶咖啡等工业产品常用的原料。主产国包括印度尼西亚、越南以及科特迪瓦、阿尔及利亚和安哥拉等西非国家。

最后，有利比里亚，这个品种最初来自西非，但因为无法抵抗叶锈病，在全球范围内很少被使用，通常仅在国内交易或用于研究目的。此外，由国际咖啡组织统计显示，在全球市场上，大约65%是由阿拉比卡制成，而35%为罗布斯塔，这两者通过形状（细长扁平或浑圆）可以轻易区分开来。