在咖啡的世界里，人们通常熟知三大原生种——阿拉比卡、罗布斯塔和利比里亚。然而，在市场上流通的主要是前两者。每一种咖啡都有其独特之处，不同用途需要不同的选择。

咖啡属下的植物多达40种，但真正能产出可消费豆子的，只有这三大原生种。这三种被称为“咖啡三大原生种”。

阿拉比卡（学名Coffea arabica），源自埃塞俄比亚高原，是最受欢迎的饮料之一。它占了全球70%以上的市场份额，因为它的风味和香气超凡脱俗。但是，它对干燥、霜冻以及病虫害特别脆弱，尤其是叶锈病。

阿拉比卡主要产于南美洲、中美洲非洲（包括肯尼亚和埃塞俄比亚）以及亚洲的一些地区。

罗布斯塔（学名Coffea robusta Linden），发现于刚果，对抗叶锈病能力更强，可以在不适合阿拉比卡生长的地方繁殖。虽然只占混合咖啡2%~3%，但它提供了鲜明且强烈的口感，这使得它非常适合用于工业生产，如速溶咖啡、灌装 咖啡等。此外，由于含有较高量的人体兴奋剂—咖啡因，所以经常用于那些寻求刺激效果的人群。

罗布斯塔主要产自印度尼西亚越南科特迪瓦、阿尔及利亚安哥拉西非国家，以及越来越多地用于出口至全球市场。

利比里亚（学名Coffea liberica），又称为野生的或原始品种，最初分布在西非。在环境变化中表现出极大的耐性，但对叶锈病依旧敏感，而且与其他两者的风味相比较显得平淡无奇，因此仅限于研究使用或者国内交易买卖。

根据国际coffee组织(ICO)统计，除去各国内部消费的大部分，在国际市场上的60%左右属于Arabica，而剩余40%则是Robusta。通过形状可以轻易区分这两者的不同，即扁长型为Arabica而圆润型为Robusta。