咖啡主要分为三大类——阿拉比卡种（Arabica）、罗布斯塔种（Robusta）和利比里亚种（Liberica），但在市场上流通的多是阿拉比卡和罗布斯塔两种。不论何种都有其优缺点，使用的目的与用途亦不尽相同。咖啡属的植物约有40种，但能够生产出具有商品价值咖啡豆的仅有阿拉比卡种、罗布斯塔种和利比里亚種，这三種稱為“咖啡三大原生種”。

阿拉比卡種（學名Coffea arabica）

阿拉比卡種的原產地是埃塞俄比亞的阿貝西尼亞高原（即現在的埃塞俄比亞高原）。初期主要作為藥物食用，13世紀培養出烘焙飲用的習慣，16世紀經由阿拉伯地區傳入歐洲，進而成為全世界人們共同喜愛的大眾飲料。所有咖啡中，阿拉白加種中的含量占75%~80%，它們優秀風味與香氣，使他們成為這些原生品種中唯一能夠直接飲用的品種。但它們對於乾燥、霜害、病蟲害等抵抗力過低，特別是不耐 咖啡天敵——葉銹病。

羅布斯塔種（學名Coffea robusta Linden）

在非洲剛果發現的一個耐葉銹病品系，不適合於阿拉白加科ffee生長的地帶就是羅布斯塔科ffee生長的地方。羅布斯塔科ffee具有獨特香味與苦味，只占混合口感的小部分，但整杯可就成了羅布斯達風味。它們風味強烈，如果想要直接品嘗恐怕得再考慮一下。他們通常被用于速溶口感、灌裝口感及液體口感等工業製造雞尾酒上。

利別里亞科ffee

西非為利別里亞科coffee 的原始產地，這些生物對於不論是高溫或低溫、高濕或干旱等各類環境皆有很強適應能力唯獨不耐葉銹病且風味較差，因此僅在西非部分國家內部交易買賣或者栽培供研究使用。

根據ICO (國際喫茶組織) 的統計扣除各喫茶國家內部交易後，在世界市場流通中的約65% 為喫茶Ara, 35% 為BostsTavikar,Ara 特徵是一粒細長且扁平，而 BostsTavikar 的則較圓形，由形狀便可以輕易辨識出來。